西暦2114年、地球人類は滅亡の危機へと晒された。

謎のケイ素生命体、フェストゥムの登場によって、地球の人口はおよそ半分まで減ってしまったのである。
しかし、人類は謎多き生物の侵攻と戦い、多くの悲劇と共に時代は進み、いつしかフェストゥムは、その活動を何故か突如として休止した。

そうして十年に及ぶ苦難の時代を一時的に乗り越えた人類は、新たな人類の秩序の集合体として地球連合を結成した後、西暦の次の新たな暦――コズミック・イラ（C.E）から始まる、宇宙開拓時代へと歩みを進めたのである。

人類は宇宙へと適応する新人類を生み出すべく、遺伝子操作によって従来の人間を遥かに超える優秀な存在――コーディネイターを誕生させた。
宇宙へと進出したコーディネイターたちは、地球の支配下にあるコロニー――プラントを創設、この頃から、遺伝子操作を介さない純粋な人類――ナチュラルと、コーディネイターは対立の始まりを見せていた。

しかしながら、その対立の傾向も一時的に止められることとなる。またも人類の敵、フェストゥムがその活動を再開したからである。
その圧倒的な戦力で地球やプラントを襲う敵に、人々は対立を忘れ、一つとなって戦った。

そうして戦いを続け、C.E.22年、北極圏に存在していた敵の中枢――地球上のフェストゥムたちを統括し、彼らの脳とも言うべき存在、コアを破壊することに人類は成功。
敵の残党との戦いは以後も続くも、人類はもう一度安寧の時代を迎えることとなった。

だが、その三年後――C.E.25年、地球側とプラントの交渉の席での爆破テロをきっかけとし、プラントの農業用コロニー「ユニウスセブン」が、地球軍側の核ミサイル攻撃の報復によって壊滅。
のちに血のバレンタインと呼ばれた事件により、急激にナチュラルとコーディネイターの対立は進み、地球連合とプラントの戦争が始まってしまう。

ナチュラルとコーディネイターの戦争とも言われるこの戦いは、当初、数で圧倒的に勝る地球連合の勝利が予想されていたが、多くの要因が重なり、連合は激しく消耗、戦いは長引くこととなってしまう。

突然に木星方面から現れた、木星蜥蜴と呼称されるエイリアンによる攻撃が開始、火星や月の裏側は制圧され、さらには木星蜥蜴はプラントと同盟を結び、地球各地にチューリップと呼ばれる母艦を降下させ、連合は一気にいくつもの領土をプラント・木星蜥蜴同盟に奪われてしまう。

そこへ追い打ちをかけるように、C.E.26年――外宇宙、木星方面から新たに登場した謎の異星人――のちにウルガルと正式に名称が発表された――が侵攻を開始、彼らは木星蜥蜴と共に幾度も宇宙にあった連合の基地を攻撃、勢力を拡大していき、地球側の勢力圏は一部の宇宙ステーションと地球全土の半分のみとなってしまった。

フェストゥム、プラント、木星蜥蜴、ウルガル。この四つの勢力との争いで、地球は大きく損耗し、果てのない戦いが続いていた。それでも、今日も世界は一日を迎える。新たな希望の生まれる、その日まで。

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